Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tarbp1E9Q368 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tarbp1E9Q368 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms