Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc171E9Q1U1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc171E9Q1U1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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