Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrp3E9Q1T6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrp3E9Q1T6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms