Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt78E9Q0F0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt78E9Q0F0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms