Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3095E9Q058 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3095E9Q058 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms