Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Fndc1E9Q043 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Fndc1E9Q043 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fndc1E9Q043 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms