Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Scaf11E9PZM7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Scaf11E9PZM7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Scaf11E9PZM7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms