Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srp54bE9PXC0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srp54bE9PXC0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.1 ms