Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm3298E9PW80 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm3298E9PW80 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm3298E9PW80 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3298E9PW80 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Gm3298E9PW80 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm3298E9PW80 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Gm3298E9PW80 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Gm3298E9PW80 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3298E9PW80 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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