Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3002E9PW72 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3002E9PW72 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms