Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ttc17E9PVB5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc17E9PVB5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms