Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gcn1E9PVA8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gcn1E9PVA8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gcn1E9PVA8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gcn1E9PVA8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gcn1E9PVA8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gcn1E9PVA8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gcn1E9PVA8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gcn1E9PVA8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gcn1E9PVA8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gcn1E9PVA8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gcn1E9PVA8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gcn1E9PVA8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gcn1E9PVA8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gcn1E9PVA8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gcn1E9PVA8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms