Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim5E9PV98 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms