Protein–RNA interactions for Protein: E9PV86

Mctp1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mctp1E9PV86 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mctp1E9PV86 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mctp1E9PV86 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms