Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifit3bE9PV48 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifit3bE9PV48 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms