Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syde2E9PUP1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syde2E9PUP1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde2E9PUP1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms