Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930444G20RikD3Z741 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930444G20RikD3Z741 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930444G20RikD3Z741 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930444G20RikD3Z741 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930444G20RikD3Z741 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930444G20RikD3Z741 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930444G20RikD3Z741 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4930444G20RikD3Z741 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4930444G20RikD3Z741 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4930444G20RikD3Z741 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4930444G20RikD3Z741 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
4930444G20RikD3Z741 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4930444G20RikD3Z741 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930444G20RikD3Z741 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
4930444G20RikD3Z741 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
4930444G20RikD3Z741 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930444G20RikD3Z741 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930444G20RikD3Z741 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930444G20RikD3Z741 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930444G20RikD3Z741 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930444G20RikD3Z741 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930444G20RikD3Z741 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930444G20RikD3Z741 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930444G20RikD3Z741 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930444G20RikD3Z741 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930444G20RikD3Z741 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930444G20RikD3Z741 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms