Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccnb1ip1D3Z3K2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms