Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms