Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf217D3YYI7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms