Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kif28pD3YXS5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Kif28pD3YXS5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif28pD3YXS5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif28pD3YXS5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif28pD3YXS5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif28pD3YXS5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kif28pD3YXS5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms