Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc170D3YXL0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms