Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo5D3YW29 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo5D3YW29 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo5D3YW29 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo5D3YW29 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rexo5D3YW29 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rexo5D3YW29 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rexo5D3YW29 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rexo5D3YW29 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms