Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700015F17RikD3YUK8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
1700015F17RikD3YUK8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms