Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm17333C6EQI3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm17333C6EQI3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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