Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nxpe3B9EKK6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nxpe3B9EKK6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nxpe3B9EKK6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms