Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r180B9EK86 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms