Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clip3B9EHT4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clip3B9EHT4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms