Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pnldc1B2RXZ1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pnldc1B2RXZ1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pnldc1B2RXZ1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms