Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apba1B2RUJ5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apba1B2RUJ5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms