Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otud4B2RRE7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otud4B2RRE7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms