Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Znf518bB2RRE4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms