Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Scn7aB1AYL1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn7aB1AYL1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms