Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scml2B1AVB3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scml2B1AVB3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms