Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700084M14RikB1AT01 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700084M14RikB1AT01 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms