Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rhox1B1APN4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox1B1APN4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms