Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc38A3KMP2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc38A3KMP2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc38A3KMP2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc38A3KMP2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc38A3KMP2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc38A3KMP2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc38A3KMP2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc38A3KMP2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc38A3KMP2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc38A3KMP2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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