Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prr16A3KMN5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr16A3KMN5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr16A3KMN5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr16A3KMN5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms