Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r232A2RTT5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms