Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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