Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samt1A2BED8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samt1A2BED8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms