Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubb1A2AQ07 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubb1A2AQ07 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms