Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CtcflA2APF3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms