Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc183A2AJB1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms