Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sec16aA2AIX1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sec16aA2AIX1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms