Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc163A2AGD7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc163A2AGD7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms