Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
1700023F06RikA2AB62 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
1700023F06RikA2AB62 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms