Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd5A2A8L1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms