Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trav12-2A0N8N6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms