Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930469K13RikA0A286YDB2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930469K13RikA0A286YDB2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930469K13RikA0A286YDB2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930469K13RikA0A286YDB2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930469K13RikA0A286YDB2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930469K13RikA0A286YDB2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930469K13RikA0A286YDB2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930469K13RikA0A286YDB2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930469K13RikA0A286YDB2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930469K13RikA0A286YDB2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms